MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-10

Total Repeats: 651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012133	TG	3	6	69	74	0 %	50 %	50 %	0 %	224586581
2	NC_012133	TAG	2	6	93	98	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586581
3	NC_012133	TA	3	6	120	125	50 %	50 %	0 %	0 %	224586581
4	NC_012133	T	6	6	137	142	0 %	100 %	0 %	0 %	224586581
5	NC_012133	AGA	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586581
6	NC_012133	TAT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
7	NC_012133	AC	3	6	327	332	50 %	0 %	0 %	50 %	224586581
8	NC_012133	TTGACT	2	12	417	428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	224586581
9	NC_012133	AAT	3	9	452	460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
10	NC_012133	AT	3	6	506	511	50 %	50 %	0 %	0 %	224586581
11	NC_012133	T	6	6	562	567	0 %	100 %	0 %	0 %	224586581
12	NC_012133	A	6	6	588	593	100 %	0 %	0 %	0 %	224586581
13	NC_012133	T	6	6	631	636	0 %	100 %	0 %	0 %	224586581
14	NC_012133	CT	3	6	677	682	0 %	50 %	0 %	50 %	224586581
15	NC_012133	CTT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586581
16	NC_012133	TAA	2	6	721	726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
17	NC_012133	TCT	2	6	749	754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586581
18	NC_012133	T	6	6	754	759	0 %	100 %	0 %	0 %	224586581
19	NC_012133	TAA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
20	NC_012133	TTA	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
21	NC_012133	ATT	2	6	927	932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
22	NC_012133	GCTTTG	2	12	941	952	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	224586581
23	NC_012133	ATG	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586581
24	NC_012133	ATT	2	6	1053	1058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
25	NC_012133	AGC	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586581
26	NC_012133	TAA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
27	NC_012133	GGA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586581
28	NC_012133	TATC	2	8	1260	1267	25 %	50 %	0 %	25 %	224586581
29	NC_012133	ATT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
30	NC_012133	A	7	7	1294	1300	100 %	0 %	0 %	0 %	224586581
31	NC_012133	A	6	6	1307	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	224586601
32	NC_012133	TGAAAA	2	12	1317	1328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224586601
33	NC_012133	A	8	8	1325	1332	100 %	0 %	0 %	0 %	224586601
34	NC_012133	GAA	2	6	1333	1338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586601
35	NC_012133	AGA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586601
36	NC_012133	TA	3	6	1414	1419	50 %	50 %	0 %	0 %	224586601
37	NC_012133	ATA	2	6	1439	1444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586601
38	NC_012133	AG	5	10	1515	1524	50 %	0 %	50 %	0 %	224586601
39	NC_012133	ATT	2	6	1539	1544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586601
40	NC_012133	AGC	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586601
41	NC_012133	TAA	2	6	1608	1613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586601
42	NC_012133	ACT	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586601
43	NC_012133	AAC	2	6	1760	1765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586601
44	NC_012133	A	6	6	1800	1805	100 %	0 %	0 %	0 %	224586601
45	NC_012133	TTC	3	9	1818	1826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586601
46	NC_012133	TTA	2	6	1835	1840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586601
47	NC_012133	TTG	2	6	1850	1855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586601
48	NC_012133	AGA	2	6	1863	1868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586601
49	NC_012133	AATT	2	8	1902	1909	50 %	50 %	0 %	0 %	224586601
50	NC_012133	GTAA	2	8	1930	1937	50 %	25 %	25 %	0 %	224586601
51	NC_012133	A	6	6	2055	2060	100 %	0 %	0 %	0 %	224586606
52	NC_012133	TGA	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586606
53	NC_012133	CAA	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586606
54	NC_012133	T	6	6	2149	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	224586606
55	NC_012133	TAG	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586606
56	NC_012133	AGTTT	2	10	2239	2248	20 %	60 %	20 %	0 %	224586606
57	NC_012133	TTGAAG	2	12	2272	2283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586606
58	NC_012133	GTG	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586606
59	NC_012133	AAG	2	6	2391	2396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586606
60	NC_012133	AGA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586606
61	NC_012133	ATA	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586592
62	NC_012133	TTAGAA	2	12	2646	2657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224586592
63	NC_012133	GCT	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586592
64	NC_012133	CAAG	2	8	2688	2695	50 %	0 %	25 %	25 %	224586592
65	NC_012133	ATG	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586592
66	NC_012133	TGA	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586592
67	NC_012133	A	6	6	2775	2780	100 %	0 %	0 %	0 %	224586592
68	NC_012133	TAG	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586592
69	NC_012133	GTT	2	6	2833	2838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586592
70	NC_012133	A	6	6	2846	2851	100 %	0 %	0 %	0 %	224586592
71	NC_012133	AGA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586592
72	NC_012133	ATGTTG	2	12	2983	2994	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	224586592
73	NC_012133	ATGT	2	8	3028	3035	25 %	50 %	25 %	0 %	224586592
74	NC_012133	ATC	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586592
75	NC_012133	CAAT	2	8	3217	3224	50 %	25 %	0 %	25 %	224586592
76	NC_012133	ATC	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586592
77	NC_012133	ATT	2	6	3280	3285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586592
78	NC_012133	A	7	7	3333	3339	100 %	0 %	0 %	0 %	224586592
79	NC_012133	ACA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586577
80	NC_012133	AGT	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
81	NC_012133	A	7	7	3428	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	224586577
82	NC_012133	CAG	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586577
83	NC_012133	CAATT	2	10	3487	3496	40 %	40 %	0 %	20 %	224586577
84	NC_012133	ATC	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586577
85	NC_012133	GTG	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586577
86	NC_012133	GAT	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
87	NC_012133	CTA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586577
88	NC_012133	TAA	2	6	3745	3750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586577
89	NC_012133	ATG	3	9	3903	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
90	NC_012133	AGT	3	9	3925	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
91	NC_012133	ATT	2	6	3991	3996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
92	NC_012133	TGA	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586597
93	NC_012133	ATT	2	6	4005	4010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
94	NC_012133	A	6	6	4116	4121	100 %	0 %	0 %	0 %	224586597
95	NC_012133	ACA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586597
96	NC_012133	AGT	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586597
97	NC_012133	ATT	2	6	4224	4229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
98	NC_012133	TAA	3	9	4309	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586597
99	NC_012133	AGC	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586597
100	NC_012133	TTA	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
101	NC_012133	A	6	6	4420	4425	100 %	0 %	0 %	0 %	224586597
102	NC_012133	CTT	2	6	4457	4462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586597
103	NC_012133	AGA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586597
104	NC_012133	A	6	6	4518	4523	100 %	0 %	0 %	0 %	224586597
105	NC_012133	A	6	6	4530	4535	100 %	0 %	0 %	0 %	224586597
106	NC_012133	ATG	2	6	4586	4591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586597
107	NC_012133	GCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586597
108	NC_012133	TAA	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586597
109	NC_012133	AG	3	6	4715	4720	50 %	0 %	50 %	0 %	224586597
110	NC_012133	TCAT	2	8	4864	4871	25 %	50 %	0 %	25 %	224586597
111	NC_012133	TTGC	2	8	4895	4902	0 %	50 %	25 %	25 %	224586597
112	NC_012133	CAAA	2	8	4933	4940	75 %	0 %	0 %	25 %	224586597
113	NC_012133	GAA	3	9	5003	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586600
114	NC_012133	TTA	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586600
115	NC_012133	GTT	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586600
116	NC_012133	TGAATT	2	12	5224	5235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224586600
117	NC_012133	A	7	7	5245	5251	100 %	0 %	0 %	0 %	224586600
118	NC_012133	TGAACT	2	12	5263	5274	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224586600
119	NC_012133	ATT	2	6	5277	5282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586600
120	NC_012133	GGT	2	6	5309	5314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586600
121	NC_012133	CAAA	2	8	5331	5338	75 %	0 %	0 %	25 %	224586600
122	NC_012133	CAT	2	6	5397	5402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586600
123	NC_012133	GAC	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586576
124	NC_012133	CAA	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586576
125	NC_012133	TTA	2	6	5585	5590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586576
126	NC_012133	AT	3	6	5633	5638	50 %	50 %	0 %	0 %	224586576
127	NC_012133	TACTT	2	10	5761	5770	20 %	60 %	0 %	20 %	224586576
128	NC_012133	AT	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	224586583
129	NC_012133	CAA	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586583
130	NC_012133	TA	3	6	5952	5957	50 %	50 %	0 %	0 %	224586583
131	NC_012133	A	7	7	6092	6098	100 %	0 %	0 %	0 %	224586583
132	NC_012133	GTA	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586583
133	NC_012133	TTG	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586583
134	NC_012133	AAT	2	6	6248	6253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586613
135	NC_012133	TAATA	2	10	6319	6328	60 %	40 %	0 %	0 %	224586613
136	NC_012133	TA	3	6	6426	6431	50 %	50 %	0 %	0 %	224586613
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